Ich räume das Zimmer (im Zimmer) auf.
Ich räume den Tisch (auf dem Tisch) auf.

Hallo Marina,

generell würd ich sagen ohne Präposition mit dem Akkusativ:
'Du räumst den Garten auf. Sie räumt die Garage auf.'

Aber mit in Verbindung mit den Präpositionen in/auf mit dem Dativ - weil: Wo räume ich auf?
'Du räumst im (in dem) Garten auf. Sie räumt in der Garage auf.'

Möglich ist aber auch der Genitiv bei der Vewendung von z.B. innerhalb oder jenseits:
'Wir räumen innerhalb des Raumes auf. Sie räumen jenseits der Grenze auf.'

Gruß aus Krakow/Polen